среда, 24 апреля 2013 г.

Ученые разрабатывают новый общедоступный анализатор генома.

Ученые из Медицинского колледжа Альберта Эйнштейна университета Иешива (Albert Einstein College of Medicine of Yeshiva University) разработали новый настольный анализатор генома.

Устройство работает в паре со специальной программой-браузером, который позволяет биологам быстро и легко выполнять обработку и анализ потока информации, поступающего с устройства анализатора генома. Это общедоступное (open-source) программное обеспечение называется GenPlay и его подробное описание было опубликовано в последнем выпуске журнала "Bioinformatics".С использованием нового программного обеспечения процедура обработки и анализа полученных данных может проводиться специалистом в области информационных технологий, что позволяет ученым-биологам сосредоточиться на других, более важных делах, на планировании и проведении экспериментов, на научных исследованиях. Именно в этом и может помочь ученым программа GenPlay, которая является легким в использовании многоцелевым инструментом, и который выполняет функции визуализации, анализа и преобразования исходных данных в понятные биологам образы и представления."Впервые полный геном человека был получен 10 лет назад международным консорциумом ученых, стоимость работ в то время составила 7 миллиардов долларов" - рассказывает Эрик Бухэссира, один из разработчиков программы GenPlay. - "Сегодня полный анализ генома может быть получен уже за 10 тысяч долларов, а через несколько лет стоимость таких работ снизится до уровня ниже тысячи долларов. Такое снижение стоимости привело к появлению такой лавины новых научных данных, что ученые-биологи не в состоянии проанализировать эти данные. Программа GenPlay и предназначена для облегчения анализа этих данных".В настоящее время существует более дюжины различных программ, предназначенных для работы с генной научной информацией. Но программа GenPlay имеет по сравнению с ними множество преимуществ, самым главным из которых является ее общедоступность и открытость ее исходных кодов и форматов данных. Помимо наличия собственного формата данных, программа GenPlay может импортировать данные из трех самых распространенных форматов хранения генной информации. И, естественно, как сама программа GenPlay, так и ее исходные коды могут быть получены онлайн любым желающим, кто испытывает потребность в подобном инструменте.

Комментариев нет:

Отправить комментарий